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    chi-biotech 转录组测序


      转录组作为基因组的功能元件,包括了多种不同类别的分子,如mRNA,miRNA,lncRNA,cirRNA,rRNA,tRNA,piRNA等。每一类分子在生理响应过程中都发挥了重要的作用。理解这些分子的调控对于更好理解功能基因组极为关键。通过转录组高通量测序技术,比较不同组织、细胞之间的转录组层面的表达量变化或结构变异(如cSNP、可变剪接、融合基因等),可以揭示生物学现象或疾病发生的分子机制。


    技术参数



    样本
    类型

    总量&浓度

    文库类型

    目标RNA富集方式

    推荐数据量

    测序策略

    项目周期

    数字基因表达谱(DGE)

    Total 
    RNA

    基因组DNA

    普通转录组文库

    Olig dT磁珠调取mRNA

    ≥3G clean data

    HiSeq

    PE150

    35个工作日

    真核转录组

    m≥30 μg,c≥100 ng/μL

    普通转录组文库

    Olig dT磁珠调取mRNA

    ≥8G clean data

    HiSeq

    PE150

    35个工作日

    原核转录组

    PacBio为主,与HiSeq等其他平台结合

    普通转录组文库/链特异性文库

    Ribozero试剂盒去除rRNA

    ≥2G clean data (有参)

    ≥3G clean data(无参)

    HiSeq 

    PE150

    35个工作日

    miRNA

    m≥3 μg

    c≥200 ng/μL

    Small RNA文库

     

    ≥10M reads

    HiSeq 

    SE50

    35个工作日

    lncRNA

    m≥4 μg

    c≥120 ng/μL

    链特异性文库

    Ribozero试剂盒去除rRNA

    ≥12G clean data

    HiSeq

    PE150

    45个工作日




    生物信息分析内容





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